dc.creator | Bohm, Bianca Conrad | |
dc.date.accessioned | 2024-11-05T23:19:39Z | |
dc.date.available | 2024-11-05T23:19:39Z | |
dc.date.issued | 2024-02-20 | |
dc.identifier.citation | BOHM, Bianca Conrad. Avaliação de dados do sistema de saúde e elaboração de ferramentas de triagem. 2024. 145 f. Tese (Doutorado em Medicina Veterinária) - Faculdade de Veterinária, Universidade Federal de Pelotas, Pelotas, 2024. | pt_BR |
dc.identifier.uri | http://guaiaca.ufpel.edu.br/xmlui/handle/prefix/14474 | |
dc.description.abstract | Neglected tropical diseases, such as dengue and leptospirosis, pose a significant
public health challenge, particularly impacting impoverished populations. Dengue, an
arbovirus transmitted by mosquitoes of the Aedes aegypti genus, is continuously
expanding globally. Due to its socioeconomic impact, there is a need for the
development of tools that assist in both diagnosis and the control of vector spread.
Leptospirosis, despite being a globally important disease, exhibits high levels of
underreporting. It is a condition with low media visibility and receives limited investment
from public authorities and pharmaceutical industries. In Brazil, one way to understand
the dynamics of these diseases is through the monitoring of Health Systems, which
compile notification forms and make them available anonymously for epidemiological
studies. This thesis comprises five scientific articles with the following objectives,
respectively: Evaluate the relationship between dengue cases and deaths and their
correlation with social vulnerability; Train machine learning models for dengue case
screening; Analyze the completeness of leptospirosis notification data in Rio Grande
do Sul; Apply machine learning models to screen leptospirosis cases using patient
identification data and clinical signs; Evaluate the spatiotemporal dynamics of dengue
cases and Aedes aegypti eggs in Belo Horizonte. All studies utilized data from passive
surveillance systems. Article 1: Dengue incidence and lethality rates and their
relationship with gender, age, education, skin color, and social vulnerability were
studied using chi-square tests, ordinary least squares (OLS) analyses, and
geographically weighted regression (GWR). The results demonstrated a direct
correlation between the increase in dengue cases and areas with higher social
vulnerability and a larger population of working-age individuals. Additionally, the
disease was found to be more severe in self-declared black individuals, the elderly,
and males. Article 2: Data from the National Notifiable Diseases Information System
for the states of Rio de Janeiro and Minas Gerais in 2016 and 2019 were used to train
machine learning algorithms. Decision Trees and Multilayer Perceptron (MLP)
algorithms achieved the best results in decision metrics, with an accuracy of 98%.
Article 3: An ecological study assessed the completeness of leptospirosis data in
municipalities in Rio Grande do Sul. It was observed that 79.29% of municipalities left
some notification forms with the "final classification" field blank or filled with the number
8 (ignored). Information related to education, occupation, previous cases in humans or
animals, and laboratory diagnosis showed the highest rates of incompleteness.
Article 4: Data from leptospirosis notification forms in the state of Rio Grande do Sul
from 2007 to 2019 were used. The chi-square technique was employed to select the most relevant attributes. The Random Forest classification model achieved an
accuracy of 0.6638. Article 5: Data on the number of eggs and cases collected by
surveillance in Belo Horizonte were analyzed. It was found that the Barreiro, Norte,
and Nordeste districts presented risk clusters for cases and an increase in the number
of eggs. In the evaluation of temporal trends, a decrease in cases was observed from
2016, but there was an increase in the number of eggs. These studies aim to contribute
to the understanding and control of these diseases, assisting the surveillance system
with effective tools for diagnosis, monitoring, and intervention. | pt_BR |
dc.description.sponsorship | Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq | pt_BR |
dc.language | por | pt_BR |
dc.publisher | Universidade Federal de Pelotas | pt_BR |
dc.rights | OpenAccess | pt_BR |
dc.subject | Doenças negligenciadas | pt_BR |
dc.subject | Epidemiologia | pt_BR |
dc.subject | Sistema de informação | pt_BR |
dc.subject | Sistema único de saúde | pt_BR |
dc.subject | Vigilância em saúde | pt_BR |
dc.title | Avaliação de dados do sistema de saúde e elaboração de ferramentas de triagem | pt_BR |
dc.title.alternative | Assessment of health system data and development of screening tools | pt_BR |
dc.type | doctoralThesis | pt_BR |
dc.contributor.authorID | https://orcid.org/0000-0002-5050-7497 | pt_BR |
dc.contributor.authorLattes | http://lattes.cnpq.br/5976629703440907 | pt_BR |
dc.contributor.advisorID | https://orcid.org/0000-0002-4191-965X | pt_BR |
dc.contributor.advisorLattes | http://lattes.cnpq.br/6027763770110766 | pt_BR |
dc.description.resumo | Doenças tropicais negligenciadas, como a dengue e a leptospirose, representam um
grande problema de saúde pública e afetam principalmente populações carentes. A
dengue, uma arbovirose transmitida pelos mosquitos do gênero Aedes aegypti, está
em constante expansão global. Devido ao seu impacto socioeconômico é necessário
a elaboração de ferramentas que auxiliem tanto no diagnóstico quanto o controle da
disseminação dos vetores. A leptospirose, apesar de ser uma doença de importância
mundial, apresenta altos índices de subnotificação. É um agravo com pouca
visibilidade da mídia e que recebe pouco investimento do poder público e das
indústrias farmacêuticas. No Brasil, uma das maneiras de conhecer a dinâmica destas
doenças é através do monitoramento dos Sistemas de Saúde, que copilam as fichas
de notificação e disponibilizam de forma anonimizada para estudos epidemiológicos.
Esta tese é composta por cinco artigos científicos com os seguintes objetivos,
respectivamente: Avaliar a relação de casos e óbitos por dengue e a relação com a
vulnerabilidade social; Treinar modelos de aprendizado de máquina para a triagem de
casos de dengue; Analisar a completude das fichas de notificação dos dados de
leptospirose no Rio Grande do Sul; Aplicar modelos de aprendizagem de máquina
para realizar a triagem de casos de leptospirose utilizando dados de identificação do
paciente e dos sinais clínicos; Avaliar a dinâmica espaço temporal de casos de dengue
e ovos de Aedes aegypti em Belo Horizonte. Todos os estudos utilizaram dados do
sistema de vigilância passiva. Artigo 1: As taxas de incidência e letalidade da dengue
e sua relação com sexo, idade, escolaridade, cor da pele e vulnerabilidade social
foram estudadas por meio de testes qui-quadrado, análises de mínimos quadrados
ordinários (MQO) e regressão geograficamente ponderada (GWR). Os resultados
demonstraram que o aumento de casos de dengue teve relação direta com áreas de
maior vulnerabilidade social e com maior número de pessoas em idade ativa. Além
disso, a doença é mais grave em pessoas autodeclaradas negras, idosas e do sexo
masculino. Artigo 2: Foram utilizados dados do Sistema Nacional de Agravos de
Notificação dos estados do Rio de Janeiro e Minas Gerais dos anos de 2016 e 2019
para treinar os algoritmos de aprendizado de máquina. Os algoritmos Árvore de
Decisão e Perceptron Multicamadas (MLP) alcançaram os melhores resultados nas
métricas de decisão, com uma precisão de 98%. Artigo 3: Foi realizado um estudo
ecológico avaliando o grau de completude dos dados de leptospirose nos municípios
do Rio Grande do Sul. Observou-se que 79,29% dos municípios deixaram alguma
ficha de notificação com o campo “classificação final” em branco ou preenchido com
o número 8 (ignorada). Observou-se que informações referentes a escolaridade, ocupação, caso anterior em humanos ou animais e diagnóstico laboratorial foram que
apresentaram as maiores taxas de incompletude. Artigo 4: Foram utilizados dados
oriundos das fichas de notificação de leptospirose do estado do Rio Grande do Sul,
no período de 2007 a 2019. Para a seleção dos atributos mais relevantes, foi utilizada
a técnica do chi-quadrado. O modelo de classificação Random Forest alcançou uma
acurácia de 0.6638. Artigo 5: Foram analisados dados relativos ao número de ovos e
casos coletados pela vigilância no município de Belo Horizonte. Verificou-se que os
distritos Barreiro, Norte e Nordeste apresentaram clusters de risco para ocorrência de
casos e aumento no número de ovos. Na avaliação de tendencia temporal observouse uma diminuição dos casos a partir de 2016, porém houve o aumento do número de ovos. Estes estudos visam contribuir para o entendimento e controle dessas doenças, auxiliando o sistema de vigilância com ferramentas eficazes para o diagnóstico, monitoramento e intervenção. | pt_BR |
dc.publisher.program | Programa de Pós-Graduação em Veterinária | pt_BR |
dc.publisher.initials | UFPel | pt_BR |
dc.subject.cnpq | CIENCIAS AGRARIAS | pt_BR |
dc.publisher.country | Brasil | pt_BR |
dc.rights.license | CC BY-NC-SA | pt_BR |
dc.contributor.advisor1 | Bruhn, Fábio Raphael Pascoti | |
dc.subject.cnpq1 | MEDICINA VETERINARIA | pt_BR |