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Avaliação de dados do sistema de saúde e elaboração de ferramentas de triagem
dc.creator | Bohm, Bianca Conrad | |
dc.date.accessioned | 2024-11-05T23:19:39Z | |
dc.date.available | 2024-11-05T23:19:39Z | |
dc.date.issued | 2024-02-20 | |
dc.identifier.citation | BOHM, Bianca Conrad. Avaliação de dados do sistema de saúde e elaboração de ferramentas de triagem. 2024. 145 f. Tese (Doutorado em Medicina Veterinária) - Faculdade de Veterinária, Universidade Federal de Pelotas, Pelotas, 2024. | pt_BR |
dc.identifier.uri | http://guaiaca.ufpel.edu.br/xmlui/handle/prefix/14474 | |
dc.description.abstract | Neglected tropical diseases, such as dengue and leptospirosis, pose a significant public health challenge, particularly impacting impoverished populations. Dengue, an arbovirus transmitted by mosquitoes of the Aedes aegypti genus, is continuously expanding globally. Due to its socioeconomic impact, there is a need for the development of tools that assist in both diagnosis and the control of vector spread. Leptospirosis, despite being a globally important disease, exhibits high levels of underreporting. It is a condition with low media visibility and receives limited investment from public authorities and pharmaceutical industries. In Brazil, one way to understand the dynamics of these diseases is through the monitoring of Health Systems, which compile notification forms and make them available anonymously for epidemiological studies. This thesis comprises five scientific articles with the following objectives, respectively: Evaluate the relationship between dengue cases and deaths and their correlation with social vulnerability; Train machine learning models for dengue case screening; Analyze the completeness of leptospirosis notification data in Rio Grande do Sul; Apply machine learning models to screen leptospirosis cases using patient identification data and clinical signs; Evaluate the spatiotemporal dynamics of dengue cases and Aedes aegypti eggs in Belo Horizonte. All studies utilized data from passive surveillance systems. Article 1: Dengue incidence and lethality rates and their relationship with gender, age, education, skin color, and social vulnerability were studied using chi-square tests, ordinary least squares (OLS) analyses, and geographically weighted regression (GWR). The results demonstrated a direct correlation between the increase in dengue cases and areas with higher social vulnerability and a larger population of working-age individuals. Additionally, the disease was found to be more severe in self-declared black individuals, the elderly, and males. Article 2: Data from the National Notifiable Diseases Information System for the states of Rio de Janeiro and Minas Gerais in 2016 and 2019 were used to train machine learning algorithms. Decision Trees and Multilayer Perceptron (MLP) algorithms achieved the best results in decision metrics, with an accuracy of 98%. Article 3: An ecological study assessed the completeness of leptospirosis data in municipalities in Rio Grande do Sul. It was observed that 79.29% of municipalities left some notification forms with the "final classification" field blank or filled with the number 8 (ignored). Information related to education, occupation, previous cases in humans or animals, and laboratory diagnosis showed the highest rates of incompleteness. Article 4: Data from leptospirosis notification forms in the state of Rio Grande do Sul from 2007 to 2019 were used. The chi-square technique was employed to select the most relevant attributes. The Random Forest classification model achieved an accuracy of 0.6638. Article 5: Data on the number of eggs and cases collected by surveillance in Belo Horizonte were analyzed. It was found that the Barreiro, Norte, and Nordeste districts presented risk clusters for cases and an increase in the number of eggs. In the evaluation of temporal trends, a decrease in cases was observed from 2016, but there was an increase in the number of eggs. These studies aim to contribute to the understanding and control of these diseases, assisting the surveillance system with effective tools for diagnosis, monitoring, and intervention. | pt_BR |
dc.description.sponsorship | Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq | pt_BR |
dc.language | por | pt_BR |
dc.publisher | Universidade Federal de Pelotas | pt_BR |
dc.rights | OpenAccess | pt_BR |
dc.subject | Doenças negligenciadas | pt_BR |
dc.subject | Epidemiologia | pt_BR |
dc.subject | Sistema de informação | pt_BR |
dc.subject | Sistema único de saúde | pt_BR |
dc.subject | Vigilância em saúde | pt_BR |
dc.title | Avaliação de dados do sistema de saúde e elaboração de ferramentas de triagem | pt_BR |
dc.title.alternative | Assessment of health system data and development of screening tools | pt_BR |
dc.type | doctoralThesis | pt_BR |
dc.contributor.authorID | https://orcid.org/0000-0002-5050-7497 | pt_BR |
dc.contributor.authorLattes | http://lattes.cnpq.br/5976629703440907 | pt_BR |
dc.contributor.advisorID | https://orcid.org/0000-0002-4191-965X | pt_BR |
dc.contributor.advisorLattes | http://lattes.cnpq.br/6027763770110766 | pt_BR |
dc.description.resumo | Doenças tropicais negligenciadas, como a dengue e a leptospirose, representam um grande problema de saúde pública e afetam principalmente populações carentes. A dengue, uma arbovirose transmitida pelos mosquitos do gênero Aedes aegypti, está em constante expansão global. Devido ao seu impacto socioeconômico é necessário a elaboração de ferramentas que auxiliem tanto no diagnóstico quanto o controle da disseminação dos vetores. A leptospirose, apesar de ser uma doença de importância mundial, apresenta altos índices de subnotificação. É um agravo com pouca visibilidade da mídia e que recebe pouco investimento do poder público e das indústrias farmacêuticas. No Brasil, uma das maneiras de conhecer a dinâmica destas doenças é através do monitoramento dos Sistemas de Saúde, que copilam as fichas de notificação e disponibilizam de forma anonimizada para estudos epidemiológicos. Esta tese é composta por cinco artigos científicos com os seguintes objetivos, respectivamente: Avaliar a relação de casos e óbitos por dengue e a relação com a vulnerabilidade social; Treinar modelos de aprendizado de máquina para a triagem de casos de dengue; Analisar a completude das fichas de notificação dos dados de leptospirose no Rio Grande do Sul; Aplicar modelos de aprendizagem de máquina para realizar a triagem de casos de leptospirose utilizando dados de identificação do paciente e dos sinais clínicos; Avaliar a dinâmica espaço temporal de casos de dengue e ovos de Aedes aegypti em Belo Horizonte. Todos os estudos utilizaram dados do sistema de vigilância passiva. Artigo 1: As taxas de incidência e letalidade da dengue e sua relação com sexo, idade, escolaridade, cor da pele e vulnerabilidade social foram estudadas por meio de testes qui-quadrado, análises de mínimos quadrados ordinários (MQO) e regressão geograficamente ponderada (GWR). Os resultados demonstraram que o aumento de casos de dengue teve relação direta com áreas de maior vulnerabilidade social e com maior número de pessoas em idade ativa. Além disso, a doença é mais grave em pessoas autodeclaradas negras, idosas e do sexo masculino. Artigo 2: Foram utilizados dados do Sistema Nacional de Agravos de Notificação dos estados do Rio de Janeiro e Minas Gerais dos anos de 2016 e 2019 para treinar os algoritmos de aprendizado de máquina. Os algoritmos Árvore de Decisão e Perceptron Multicamadas (MLP) alcançaram os melhores resultados nas métricas de decisão, com uma precisão de 98%. Artigo 3: Foi realizado um estudo ecológico avaliando o grau de completude dos dados de leptospirose nos municípios do Rio Grande do Sul. Observou-se que 79,29% dos municípios deixaram alguma ficha de notificação com o campo “classificação final” em branco ou preenchido com o número 8 (ignorada). Observou-se que informações referentes a escolaridade, ocupação, caso anterior em humanos ou animais e diagnóstico laboratorial foram que apresentaram as maiores taxas de incompletude. Artigo 4: Foram utilizados dados oriundos das fichas de notificação de leptospirose do estado do Rio Grande do Sul, no período de 2007 a 2019. Para a seleção dos atributos mais relevantes, foi utilizada a técnica do chi-quadrado. O modelo de classificação Random Forest alcançou uma acurácia de 0.6638. Artigo 5: Foram analisados dados relativos ao número de ovos e casos coletados pela vigilância no município de Belo Horizonte. Verificou-se que os distritos Barreiro, Norte e Nordeste apresentaram clusters de risco para ocorrência de casos e aumento no número de ovos. Na avaliação de tendencia temporal observouse uma diminuição dos casos a partir de 2016, porém houve o aumento do número de ovos. Estes estudos visam contribuir para o entendimento e controle dessas doenças, auxiliando o sistema de vigilância com ferramentas eficazes para o diagnóstico, monitoramento e intervenção. | pt_BR |
dc.publisher.program | Programa de Pós-Graduação em Veterinária | pt_BR |
dc.publisher.initials | UFPel | pt_BR |
dc.subject.cnpq | CIENCIAS AGRARIAS | pt_BR |
dc.publisher.country | Brasil | pt_BR |
dc.rights.license | CC BY-NC-SA | pt_BR |
dc.contributor.advisor1 | Bruhn, Fábio Raphael Pascoti | |
dc.subject.cnpq1 | MEDICINA VETERINARIA | pt_BR |