| dc.creator | Vieira, Thainá Dutra | |
| dc.date.accessioned | 2025-10-16T11:08:17Z | |
| dc.date.available | 2025-10-16T11:08:17Z | |
| dc.date.issued | 2016-02-29 | |
| dc.identifier.citation | VIEIRA, Thainá Dutra; Caracterização molecular e relações filogenéticas de Diplotriaena bargusinica Skrjabin, 1917 (Nematoda: Diplotriaenidae). 2016. 53 f. Dissertação (Mestrado em Microbiologia e Parasitologia) - Instituto de Biologia, Universidade Federal de Pelotas, Pelotas, 2016. | pt_BR |
| dc.identifier.uri | http://guaiaca.ufpel.edu.br/xmlui/handle/prefix/18108 | |
| dc.description.abstract | The nematode taxonomy is based mainly on the morphological and morphometric features. They are among the most difficult pests to be identified due to the small size of some species and/or difficulties in observing essential character for diagnosis by conventional optical microscopy. Diplotriaena bargusinica is a parasite of birds whose identification is based strongly on morphological characteristics. The morphology of the specimens used in this study has raised questions about the specific identification, due to variations in shape in the spicules of males. The increasing knowledge of the variability of genetic information has encouraged the use of DNA markers, in combination with morphological data for inferring phylogenetic relationships among different taxa. The organization of rDNA genes make them appropriate targets for DNA amplification by PCR, allowing genetic studies aimed at identifying nematodes. In view of the importance of taxonomy with the potential of molecular biology, this study aims to confirm the morphological identification of D. bargusinica and establish phylogenetic relationships among the parasites of Spirurida order. Twenty partial sequences of the 18S region of nuclear rDNA from D. bargusinica were generated by DNA sequencing, these being the first genetic data for the species. Based on the analysis of the genetic distance matrix was observed little difference between the genetic sequences, with only three showed variable sites. Phylogenetic trees were obtained by the methods: Neighbor-Joining, Minimum Evolution and Maximum Likelihood. Both had very similar topology, showing that the clades are monophyletic origin and corroborated phylogenetic analysis based on the traditional taxonomy. In this study, the molecular and morphological data correlated were crucial to elucidate the group's taxonomy. | pt_BR |
| dc.description.sponsorship | Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES | pt_BR |
| dc.language | por | pt_BR |
| dc.publisher | Universidade Federal de Pelotas | pt_BR |
| dc.rights | OpenAccess | pt_BR |
| dc.subject | Nematoda Diplotriaenoidea | pt_BR |
| dc.subject | Marcador molecular | pt_BR |
| dc.subject | Região 18S | pt_BR |
| dc.subject | Molecular marker | pt_BR |
| dc.subject | 18S region | pt_BR |
| dc.title | Caracterização molecular e relações filogenéticas de Diplotriaena bargusinica Skrjabin, 1917 (Nematoda Diplotriaenidae) | pt_BR |
| dc.title.alternative | Molecular characterization and phylogenetic relationships of Diplotriaena bargusinica Skrjabin, 1917 (Nematoda: Diplotriaenidae) | pt_BR |
| dc.type | masterThesis | pt_BR |
| dc.contributor.authorLattes | http://lattes.cnpq.br/4140814267652675 | pt_BR |
| dc.contributor.advisorLattes | http://lattes.cnpq.br/7061100485275587 | pt_BR |
| dc.contributor.advisor-co1 | Macedo, Márcia Raquel Pegoraro de | |
| dc.contributor.advisor-co1Lattes | http://lattes.cnpq.br/1844332135747776 | pt_BR |
| dc.description.resumo | A taxonomia de nematoides é fundamentada, principalmente, em características morfológicas e morfométricas. Eles estão entre os parasitos mais difíceis de serem identificados, devido ao tamanho diminuto de algumas espécies e/ou as dificuldades na observação de características determinantes para o diagnóstico em microscopia óptica convencional. Diplotriaena bargusinica é um parasito de aves cuja identificação é fortemente baseada em caracteres morfológicos. A morfologia dos espécimes utilizados neste estudo gerou dúvidas quanto à identificação específica, devido às variações de formatos nos espículos dos machos. O crescente conhecimento sobre a variabilidade de informações genéticas tem estimulado o uso de marcadores moleculares de DNA, em conjunto com dados morfológicos, para inferir o relacionamento filogenético de diversos táxons. A organização dos genes do DNAr os tornam alvos adequados para a amplificação do DNA por PCR, permitindo os estudos genéticos que visam a identificação de nematoides. Considerando a importância da taxonomia com o potencial da biologia molecular, esse estudo visa confirmar a identificação morfológica de D. bargusinica, bem como estabelecer relações filogenéticas com parasitos da ordem Spirurida. Vinte sequências parciais da região 18S do DNAr nuclear de D. bargusinica foram geradas, sendo estes, os primeiros dados genéticos disponíveis sobre a espécie. Com base na análise da matriz de distância genética observou-se pouca diferenciação genética entre as sequências, sendo que apenas três apresentaram sítios variáveis. As árvores filogenéticas foram obtidas através dos métodos de Neighbor-Joining, Evolução Mínima e Máxima Verossimilhança. Ambas apresentaram topologia muito similar, mostrando que os clados obtidos apresentam origem monofilética e corroboraram com as análises filogenéticas baseadas na taxonomia tradicional. Neste estudo os dados moleculares associados aos morfológicos foram essenciais para elucidar a taxonomia do grupo. | pt_BR |
| dc.publisher.program | Programa de Pós-Graduação em Parasitologia | pt_BR |
| dc.publisher.initials | UFPel | pt_BR |
| dc.subject.cnpq | CIENCIAS BIOLOGICAS | pt_BR |
| dc.publisher.country | Brasil | pt_BR |
| dc.rights.license | CC BY-NC-SA | pt_BR |
| dc.contributor.advisor1 | Antunes, Gertrud Müller | |
| dc.subject.cnpq1 | PARASITOLOGIA | pt_BR |