dc.creator | Santos, Éricmar Avila dos | |
dc.date.accessioned | 2020-05-11T15:28:17Z | |
dc.date.available | 2020-05-11T15:28:17Z | |
dc.date.issued | 2019-02-23 | |
dc.identifier.citation | Santos, Éricmar Avila dos. Prospecção de vírus de RNA para o desenvolvimento
de vetor de silenciamento em Euschistus heros (Hemiptera: Pentatomidae).
2019. 52f. Dissertação (Mestrado em Entomologia) - Programa de Pós-Graduação em
Entomologia, Instituto de Biologia, Universidade Federal de Pelotas, Pelotas, 2019. | pt_BR |
dc.identifier.uri | http://guaiaca.ufpel.edu.br/handle/prefix/5256 | |
dc.description.abstract | The neotropical brown stink bug, Euschistus heros (F.) (Hemiptera: Pentatomidae), is
a major phytophagous insect pest that causes considerable economic losses in
soybean crops. Due to the sudden increase in the economic importance of this pest,
there are limited management strategies currently available, mostly relying on highly
toxic wide-spectrum insecticides. For this reason, there is a strong dependence on the
use of non-selective and highly toxic broad-spectrum insecticides that can persist in
the environment and affect non-target organisms. Thus, it is crucial to develop new
tools, which are efficient and reduce the environmental impact. In this way, the RNA
interference (RNAi) technique represents has potential for the development of new
insect management strategies. There are several applications of RNAi in insect
management, by means of transformative or non-transformative strategies. The virusinduced
gene silencing (VIGS) is among the non-transformative strategies. This
strategy is based on a genetically modified virus for target gene silencing after insecthost
infection. In order to develop solutions based on VIGS, it is necessary to carry out
the identification, molecular characterization, biological characterization and
construction of an infectious clone of a virus species capable of infecting and
replicating the target insect. In this context, the objective of this work is to identify and
characterize an RNA virus in E. heros with potential use in the construction of a VIGS
vector. For this purpose, the sequencing of E. heros transcriptome and subsequent
assembly and identification of viral transcripts was performed. The viral genome with
the highest number of transcripts per million was selected for the molecular
characterization, for identification of distribution in the productive regions of Brazil and
for the construction of an infectious clone enabling more in-depth studies of its biology
and subsequent development of a vector of VIGS. Five virus species were identified,
amongst them the Halyomorpha halys virus (HhV) (Picornavirales: Iflaviridae)
represented 99.9% of the absolute viral transcripts count, in this way, the HhV was
selected for the next steps. HhV is a + ssRNA virus with approximately 9 kb in length,
composed of 5 'UTR, a polyprotein ORF and a 3'UTR containing a poly A tail. The
study of its distribution indicated that there is a pattern of occurrence or difference in
viral load between the populations of E. heros from the south and from the central-west
and southeast regions of Brazil. It was possible to amplify the HhV virus genome in 4
fragments, of which the last three were effectively cloned into plasmids. The results
indicate that HhV is potential candidate for the development of a VIGS vector in E.
heros, however, further experiments are needed to elucidate its distribution, host
amplitude and to construct an infectious clone, which will be the necessary base to
characterize the biology of the virus and to develop a VIGS vector in E. heros. | pt_BR |
dc.description.sponsorship | Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES | pt_BR |
dc.language | por | pt_BR |
dc.publisher | Universidade Federal de Pelotas | pt_BR |
dc.rights | OpenAccess | pt_BR |
dc.subject | Entomologia | pt_BR |
dc.subject | Percevejo-marrom | pt_BR |
dc.subject | Euschistus heros (F.) | pt_BR |
dc.subject | Neotropical stinkbug | pt_BR |
dc.subject | Iflaviridae | pt_BR |
dc.title | Prospecção de vírus de RNA para o desenvolvimento de vetor de silenciamento em Euschistus heros (Hemiptera: Pentatomidae) | pt_BR |
dc.title.alternative | Prospection of RNA viruses for silencing vector development in Euschistus heros (Hemiptera: Pentatomidae) | pt_BR |
dc.type | masterThesis | pt_BR |
dc.contributor.authorID | | pt_BR |
dc.contributor.authorLattes | http://lattes.cnpq.br/8733019749035317 | pt_BR |
dc.contributor.advisorID | | pt_BR |
dc.contributor.advisorLattes | http://lattes.cnpq.br/5332476815885964 | pt_BR |
dc.description.resumo | O percevejo marrom, Euschistus heros (F.) (Hemiptera: Pentatomidae), é uma
importante espécie de inseto-praga fitófago por causar perdas econômicas
consideráveis na cultura da soja. Devido ao súbito aumento na importância econômica
desta praga, existem limitadas opções de manejo disponíveis para os produtores. Por
esse motivo, existe uma forte dependência do uso de inseticidas de amplo espectro,
não seletivos e altamente tóxicos, que podem persistir no meio ambiente e afetar
organismos não-alvo. Dessa forma, é fundamental o desenvolvimento de novas
ferramentas que sejam eficientes na proteção dos cultivos e que causem menor
impacto ambiental. Nesse sentido, a técnica de RNA interferente (RNAi) apresenta
potencial para o desenvolvimento de novas estratégias no manejo de insetos. Existem
diversas formas de aplicação do RNAi para o manejo de insetos, por vias
transformativas ou não-transformativas. Dentre as estratégias não-transformativas, se
encontra o silenciamento gênico induzido por vírus (VIGS). Essa estratégia consiste
no uso de um vírus geneticamente modificado para induzir o silenciamento de um
gene alvo após a infectar um inseto-hospedeiro. Para que seja possível desenvolver
soluções baseadas em VIGS, é necessário realizar a identificação, caracterização
molecular, caracterização biológica e construção de um clone infeccioso de uma
espécie de vírus capaz de infectar e se replicar no inseto-alvo. Nesse sentido, o
objetivo deste estudo é identificar e caracterizar um vírus de RNA em E. heros com
potencial utilização na construção de um vetor de VIGS. Dessa forma, foi realizado o
sequenciamento do transcriptoma de E. heros e posterior montagem e identificação
dos transcritos virais. O genoma viral com maior número de transcritos por milhão foi
selecionado para a realização da caracterização molecular, identificação de sua
distribuição nas regiões produtivas do Brasil e para a construção de um clone
infeccioso possibilitando estudos mais aprofundados de sua biologia e posterior
desenvolvimento de um vetor de VIGS. Foram identificadas 5 espécies de vírus, entre
estes, o Halyomorpha halys vírus (HhV) (Picornavirales, Iflaviridae) que representou
99,9% da contagem total de transcritos virais identificados, portanto foi selecionado
para as etapas seguintes. O HhV é um vírus de +ssRNA com aproximadamente 9kb
de comprimento, composto por 5 'UTR, uma ORF de poliproteína e um 3’UTR
contendo uma cauda poli A. O estudo de sua distribuição indica que existe um padrão
de ocorrência ou de diferença de carga viral entre as populações de E. heros do sul e
das regiões centro-oeste e sudeste do Brasil. Foi possível amplificar o genoma do
vírus HhV em 4 fragmentos, dentre estes, os últimos três foram efetivamente clonados
em plasmídeos. Os resultados obtidos indicam que o HhV apresenta potencial para o
desenvolvimento de um vetor de VIGS em E. heros, no entanto, são necessários mais
experimentos para elucidar sua distribuição, amplitude de hospedeiros e para
construir um clone infeccioso, que será a base necessária para caracterizar a biologia
do vírus e para desenvolver um vetor VIGS em E. heros. | pt_BR |
dc.publisher.department | Instituto de Biologia | pt_BR |
dc.publisher.program | Programa de Pós-Graduação em Entomologia | pt_BR |
dc.publisher.initials | UFPel | pt_BR |
dc.subject.cnpq | CNPQ::CIENCIAS AGRARIAS::AGRONOMIA::FITOSSANIDADE::ENTOMOLOGIA AGRICOLA | pt_BR |
dc.publisher.country | Brasil | pt_BR |
dc.contributor.advisor1 | Zotti, Moises João | |