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dc.creatorGonçalves, Jênifer Malheiros
dc.date.accessioned2022-12-29T09:23:33Z
dc.date.available2022-12-28
dc.date.available2022-12-29T09:23:33Z
dc.date.issued2020-02-19
dc.identifier.citationGONÇALVES, Jênifer Malheiros. Construção de quimeras recombinantes contendo antígenos de Bartonella henselae. 2020. 98f. Tese (Doutorado em Biotecnologia) - Centro de Desenvolvimento Tecnológico, Universidade Federal de Pelotas. Pelotas, 2020.pt_BR
dc.identifier.urihttp://guaiaca.ufpel.edu.br/handle/prefix/8866
dc.description.abstractBartonella henselae is a facultative gram-negative and intracellular bacterium, where cats are its primary reservoir and humans are accidental hosts. B. henselae is considered one of the most important medical species, causing the zoonosis known as Cat Scratch Disease (CSD). The diagnosis of CSD is still a challenge since conventional techniques for detecting antigens or antibodies have demonstrated limitations. The gold standard diagnosis of CSD is IFI, with good sensitivity, however, with the possibility of cross-reactions with other species. Given this, bioinformatics tools have been used worldwide, optimizing the search for new diagnostic alternatives. Thus, the objective of the present work was to identify, through immuno-bioinformatics analyzes, epitopes of B. henselae, and to build multi-epitope recombinant chimeras for use as biotechnological inputs. The seven most cited antigens in scientific articles (GroEL, 17kDa, P26, BadA, Pap31, OMP89 and OMP43) were chosen for the epitope identification and selection phase. B cell epitopes were selected using two predictors (BepiPred and Iedb). The three-dimensional study of proteins, as well as structural quality analyzes, physical-chemical and antigenicity analyzes were performed using the I-TASSER, QMEAN6 and Protoparam servers, respectively. The analysis of the secondary structures of the mRNA were performed to verify the stability of the translation of proteins using the RNAfold software. Next, the in silico drawing of the chimeras was done and sent to chemical synthesis. Three recombinant chimeras (rC) were formed, being composed of epitopes present in the GroEL, 17kDa and P26 (rC1) proteins; BadA, Pap31 and GroEL (rC2) and P26, OMP89 and OMP43 (rC3). Recombinant chimeras (rC) were cloned into an expression vector in Escherichia coli, pAE. The antigenicity of the proteins was verified through Western Blot (WB) with human serum naturally infected by B. henselae. All chimeric proteins were successfully expressed, insoluble, and with an expected molecular mass of 37 kDa (rC1), 35 kDa (rC2) and 38 kDa (rC3). Quality analyzes showed that rC2 was a slightly better construction than the others. Analyzes of secondary mRNA structures revealed that they had sufficient stability to effectively translate proteins. All chimeras were shown tobe antigenic through the WB. The chimeras produced have potential for use in diagnostic tests.pt_BR
dc.description.sponsorshipCoordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPESpt_BR
dc.languageporpt_BR
dc.publisherUniversidade Federal de Pelotaspt_BR
dc.rightsOpenAccesspt_BR
dc.subjectProteína recombinantept_BR
dc.subjectCSDpt_BR
dc.subjectDoença da arranhadura do gatopt_BR
dc.subjectIn silicopt_BR
dc.subjectDiagnósticopt_BR
dc.subjectRecombinant proteinpt_BR
dc.subjectCat scratch diseasept_BR
dc.subjectDiagnosispt_BR
dc.titleConstrução de quimeras recombinantes contendo antígenos de Bartonella henselaept_BR
dc.title.alternativeConstruction of recombinant chimeras containing Bartonella henselae antigenspt_BR
dc.typedoctoralThesispt_BR
dc.contributor.authorIDpt_BR
dc.contributor.authorLatteshttp://lattes.cnpq.br/3849143443163290pt_BR
dc.contributor.advisorIDpt_BR
dc.contributor.advisorLatteshttp://lattes.cnpq.br/0131111340559161pt_BR
dc.description.resumoBartonella henselae é uma bactéria Gram-negativa e intracelular facultativa, onde os gatos são seu reservatório primário e os seres humanos seus hospedeiros acidentais. B. henselae é causadora da zoonose conhecida como Doença da Arranhadura do Gato (Cat Scratch Disease - CSD). O diagnóstico da CSD ainda é um desafio, pois as técnicas convencionais de detecção de antígenos ou anticorpos têm demonstrado limitações. O diagnóstico padrão-ouro da CSD é a Imunofluorescência, com boa sensibilidade, entretanto, com possibilidade de reações cruzadas com outras espécies. Diante disto, as ferramentas de bioinformática têm sido utilizadas em todo o mundo, otimizando a busca por novas alternativas de diagnóstico. Assim, o objetivo do presente trabalho foi identificar, através de análises de imuno-bioinformática, epítopos de B. henselae, e construir quimeras recombinantes multi-epítopo para uso como insumos biotecnológicos. Os sete antígenos mais citados em artigos científicos (GroEL, 17kDa, P26, BadA, Pap31, OMP89 e OMP43) foram escolhidos para a fase de identificação e seleção dos epítopos. Os epítopos de células B foram selecionados usando dois preditores (BepiPred e Iedb). O estudo tridimensional das proteínas, bem como análises de qualidade estrutural, análises físico-químicas e de antigenicidade foram feitos através do servidor I-TASSER, QMEAN6 e do servidor Protoparam, respectivamente. A análises das estruturas secundárias do mRNA foram performadas para verificar a estabilidade da tradução das proteínas através do software RNAfold. A seguir, o desenho in silico das quimeras foi feito e as mesmas enviadas para síntese química. Três quimeras recombinantes (rC) foram constituídas, sendo elas compostas por epítopos presentes nas proteínas GroEL, 17kDa e P26 (rC1); BadA, Pap31 e GroEL (rC2) e P26, OMP89 e OMP43 (rC3). As quimeras recombinantes (rC) foram clonadas em vetor de expressão em Escherichia coli, pAE. A antigenicidade das proteínas foi verificada através de Western Blot (WB) com soro de humano naturalmente infectado por B. henselae. Todas as proteínas quiméricas foram expressas com sucesso, de forma insolúvel, e com massa molecular esperada de 36 kDa (rC1), 34 kDa (rC2) e 38 kDa (rC3). As análises de qualidade demonstraram quea rC2 foi a construção ligeiramente melhor que as demais. As análises das estruturas secundárias do mRNA revelaram que estes tinham estabilidade suficiente para traduzir efetivamente as proteínas. Todas as quimeras mostraram-se antigênicas através do WB. As quimeras recombinantes produzidas têm potencial para uso biotecnológico no desenvolvimento de testes de diagnóstico.pt_BR
dc.publisher.departmentCentro de Desenvolvimento Tecnológicopt_BR
dc.publisher.programPrograma de Pós-Graduação em Biotecnologiapt_BR
dc.publisher.initialsUFPelpt_BR
dc.subject.cnpqCNPQ::CIENCIAS AGRARIAS::MEDICINA VETERINARIA::PATOLOGIA ANIMALpt_BR
dc.publisher.countryBrasilpt_BR
dc.relation.referencesGONÇALVES, Jênifer Malheiros. Construção de quimeras recombinantes contendo antígenos de Bartonella henselae. 2020. 98f. Tese (Doutorado em Biotecnologia) - Centro de Desenvolvimento Tecnológico, Universidade Federal de Pelotas. Pelotas, 2020.pt_BR
dc.contributor.advisor1Hartwig, Daiane Drawanz


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