Fenotipagem, genotipagem e mapeamento de características de importância agronômica em arroz
Resumo
Em arroz, a produtividade é uma característica complexa, influenciada por diferentes
componentes. Identificar genes que controlam essas características é importante para
a obtenção de cultivares mais produtivas. Em seu ambiente de cultivo o arroz pode ter
sua produtividade reduzida pelos estresses bióticos e abióticos, como a salinidade.
Com o avanço das ferramentas de biotecnologia, como a genotipagem utilizando os
marcadores SNPs (polimorfismo de nucleotídeo único) de alta densidade, os estudos
da genômica do arroz foram impulsionados, auxiliando os melhoristas. Nas últimas
décadas, estudos de associação genômica ampla tem sido utilizada frequentemente
em arroz para a identificação de SNPs. No entanto, há poucos relatos da utilização de
germoplasma de arroz brasileiro nesses estudos. Desta forma, o objetivo deste
trabalho foi a genotipagem, fenotipagem e mapeamento de características de
interesse agronômico em germoplasma de arroz utilizado no Brasil. Para isso, foi
utilizada uma coleção com 188 acessos de arroz cultivados no País. Essa coleção foi
genotipada com 7098 marcadores SNPs. A genotipagem foi utilizada para estimar a
variabilidade genética, além da estrutura da população e parentesco dos genótipos,
que foram empregados no estudo de mapeamento. Os acessos de arroz foram
fenotipados para tolerância à salinidade no estádio reprodutivo, sendo avaliado o
número de panículas por planta, número de panículas estéreis por planta e
porcentagem de esterilidade da panícula principal. Para o estudo de mapeamento os
acessos foram fenotipados para altura da planta, número de afilhos, número de
panículas por planta, comprimento da panícula principal, peso da panícula principal,
número de grão cheios da panícula principal, número de grão estéreis da panícula
principal, peso grãos da panícula principal, peso de cem grãos e produtividade por
planta. Com base na genotipagem observou-se que os acessos utilizados apresentam
pouca variabilidade genética, pois a estrutura da população, a análise de
componentes principais (PCA) e a árvore filogenética, se dividiram em dois grupos.
Considerando o estudo de fenotipagem para tolerância salinidade no estádio
reprodutivo, verificou-se que a maioria dos genótipos foram severamente afetados
pelo estresse, com número elevado de panículas totalmente estéreis. Para o estudo
de mapeamento associativo utilizando PCA, foram identificados 65 marcadores SNPs
significativos e utilizando a estrutura da população foram identificados 175
marcadores SNPs significativos, totalizando 622 genes anotados próximos a esses
SNPs significativos.