dc.creator | Cagliari, Deise | |
dc.date.accessioned | 2022-05-09T21:41:09Z | |
dc.date.available | 2022-05-09T21:41:09Z | |
dc.date.issued | 2021-03-09 | |
dc.identifier.citation | CAGLIARI, Deise. Transcriptome analysis and exploring RNAi and CRISPR in the Neotropical stink bug, Euschistus heros. 2021. 219f. Dissertation (PhD) – PostGraduation Program in Crop Protection (UFPel) and in Bioscience Engineering (UGent) | pt_BR |
dc.identifier.uri | http://guaiaca.ufpel.edu.br/handle/prefix/8383 | |
dc.description.abstract | Um dos principais fatores limitantes a produção agrícola, são o ataque de insetos,
patógenos e plantas daninhas, os quais podem causar perdas significativas.
Euschistus heros (Heteroptera: Pentatomidae) é uma das espécies de maior
importância encontradas na cultura da soja, com ocorrência distribuída em toda área
produtora brasileira. Na tentativa de reduzir os danos causados por esse e outros
insetos, produtores dependem quase que exclusivamente do uso de inseticidas.
Entretanto, o uso indiscriminado desses produtos vem causando sérios problemas de
manejo, como a seleção de populações resistentes levando a ineficiência dos
produtos disponíveis no mercado. Diante disso, é necessário o desenvolvimento de
ferramentas alternativas de controle, tais como silenciamento gênico baseado em
RNA de interferência (RNAi) e CRISPR (Repetições Palindrômicas Curtas Agrupadas
e Regularmente Interespaçadas). O RNAi é um mecanismo altamente conservado em
organismos eucariotos e pelo qual a molécula de RNA mensageiro (RNAm) é clivada
pela maquinaria de silenciamento, levando a inativação da expressão gênica
(Knockdown). Já o CRISPR é uma ferramenta de edição gênica com a qual é possível
realizar modificação a nível de DNA, introduzindo ou eliminando sequências
específicas do DNA (knockout). Nos últimos anos, a utilização do RNAi e CRISPR
tem atraído o interesse de pesquisadores no estudo das funções dos genes no
desenvolvimento e reprodução dos insetos, o que permitirá o desenvolvimento de
estratégias alternativas de controle. Assim, considerando a importância do RNAi e do
sistema CRISPR/Cas9 no estudo da genômica funcional e no desenvolvimento de
novas ferramentas para o manejo de insetos-praga, os objetivos deste estudo
incluem: i) identificar os principais componentes da maquinaria de RNAi presentes em
E. heros, assim como validar a funcionalidade dessa ferramenta em E. heros; ii) uma
revisão mostrando o uso potencial da ferramenta RNAi em uma abordagem nãotransformativa; iii) o uso do RNAi parental como ferramenta no estudo das funções
gênicas em E. heros; iv) a combinação de RNAi e CRISPR/Cas9 como ferramentas
genômicas funcionais no percevejo Neotropical, E. heros. Essas informações
fornecem novos e importantes conjuntos de dados sobre a maquinaria de RNAi e sua
eficiência, a perspectiva futura da utilização do RNAi via não-transformativa e do uso
de RNAi e CRISPR como ferramentas em estudos genéticos funcionais, apoiando
estratégias futuras para melhorar RNAi e CRISPR em E. heros e outras espécies de
insetos perfuradores e sugadores importantes na agricultura. | pt_BR |
dc.description.sponsorship | Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq | pt_BR |
dc.language | eng | pt_BR |
dc.publisher | Universidade Federal de Pelotas | pt_BR |
dc.rights | OpenAccess | pt_BR |
dc.subject | Gene silencing | pt_BR |
dc.subject | Gene knockdown | pt_BR |
dc.subject | Gene knockout | pt_BR |
dc.subject | Pest management | pt_BR |
dc.subject | Functional genomics | pt_BR |
dc.subject | Silenciamento gênico | pt_BR |
dc.subject | Manejo de insetos-praga | pt_BR |
dc.subject | Genética funcional | pt_BR |
dc.title | Transcriptome analysis and exploring RNAi and CRISPR in the Neotropical stink bug, Euschistus heros | pt_BR |
dc.title.alternative | Análise do transcriptoma e exploração do RNAi e CRISPR no percevejo neotropical, Euschistus heros | pt_BR |
dc.type | doctoralThesis | pt_BR |
dc.contributor.authorID | | pt_BR |
dc.contributor.authorLattes | http://lattes.cnpq.br/4419738369350420 | pt_BR |
dc.contributor.advisorID | | pt_BR |
dc.contributor.advisorLattes | http://lattes.cnpq.br/5332476815885964 | pt_BR |
dc.contributor.advisor-co1 | Smagghe, Guy | |
dc.contributor.advisor-co1Lattes | http://lattes.cnpq.br/5628387257846847 | pt_BR |
dc.contributor.advisor-co2 | Garcia, Flávio Roberto Mello | |
dc.contributor.advisor-co2Lattes | http://lattes.cnpq.br/0371096131093979 | pt_BR |
dc.description.resumo | One of the main factors limiting agricultural production is the attack of insects,
pathogens and weeds, which can cause significant losses in the culture. Euschistus
heros (Heteroptera: Pentatomidae) is one of the most important stink bug species
found in soybean, with occurrence distributed throughout the Brazilian production
area. In an attempt to reduce the damage caused by this and other insects, producers
depend almost exclusively on the use of insecticides. However, the indiscriminate use
of these products has been causing serious management problems, such as the
selection of resistant populations leading to the inefficiency of products available on
the market. Therefore, the development of alternative control tools, such as gene
silencing based on RNA interference (RNAi) and CRISPR (Clustered Regularly
Interspaced Short Palindromic Repeats) is necessary. RNAi is a highly conserved
mechanism in eukaryotic organisms and by which the messenger RNA molecule
(mRNA) is cleaved by the gene-silencing machinery, leading to inactivation of gene
expression (Knockdown). CRISPR, on the other hand, is a gene editing tool with which
it is possible to carry out modification at the DNA level, introducing or eliminating
specific DNA sequences from the genome (knockout). During the last years, the use
of RNAi and CRISPR has attracted the interest of researchers, mainly in the study of
the functions of genes during insect’s development and reproduction, which will allow
the future development of alternative control strategies. Thus, considering the
importance of RNAi and the CRISPR / Cas9 system in the study of functional genomics
and in the development of new tools for the management of insect pests, the objectives
of this study include: i) to identify the main components of the RNAi machinery present
in E. heros, as well as validating the functionality of this tool in E. heros; ii) a review
showing the potential use of the RNAi tool in a non-transformative approach; iii) the
use of parental RNAi as a tool in the study of gene functions in E. heros; iv) the
combination of RNAi and CRISPR/Cas9 as functional genomic tools in the Neotropical
bug, E. heros. This information provides novel and important dataset on RNAi
machinery and its efficiency, the future perspective of non-transformative RNAi
approaches and the use of RNAi and CRISPR as tools in functional genetic studies,
underpinning future strategies to improve RNAi and CRISPR in E. heros and other
piercing-sucking insects species important in agriculture. | pt_BR |
dc.publisher.department | Faculdade de Agronomia Eliseu Maciel | pt_BR |
dc.publisher.program | Programa de Pós-Graduação em Fitossanidade | pt_BR |
dc.publisher.initials | UFPel | pt_BR |
dc.subject.cnpq | CNPQ::CIENCIAS AGRARIAS::AGRONOMIA::FITOSSANIDADE | pt_BR |
dc.publisher.country | Brasil | pt_BR |
dc.contributor.advisor1 | Zotti, Moises João | |